Le port de Blankenberge remonte à la fin du dix-neuvième siècle. Les travaux ont commencé en 1862 et, en 1871, le port a été mis en service. Très vite, des problèmes sont apparus : il était difficile de prendre la mer avec le vent d’ouest et son tirant d’eau était insuffisant pour les navires à quille. Déjà en 1913, il existait des plans pour la construction d'un nouveau port sur le côté ouest du chenal. Après la guerre, en 1925, un deuxième projet a été reconsidéré, mais il n’a pas été réalisé pour des raisons budgétaires.
La pêche à Blankenberge a connu un déclin constant entre les deux guerres mondiales. En juin 1944, vers la fin de la guerre, les Allemands ont détruit l’ensemble des infrastructures portuaires. Fallait-il maintenir le port de Blankenberge ? Finalement, il a été décidé de le reconstruire, mais plus pour la pêche, plutôt pour la plaisance.
En 1953, un premier ponton pour l’amarrage des voiliers a été installé, suivi ensuite de flotteurs fixes. Le chenal a été dragué, et pendant l’été 1955, le port de Blankenberge a été officiellement transformé en port de plaisance. L’inauguration officielle a eu lieu le 9 juillet 1955. Quelques semaines plus tôt, le 3 juin, le Scarphout Yachtclub Blankenberge avait été fondé.
Dans les années 1970, on a décidé d’aménager également le bassin de chasse en marina. L’inauguration a eu lieu le 21 juin 1980, portant la capacité d’accueil à 800 bateaux. Plus récemment, la jetée (barcadère) a été réaménagée avec un chemin de randonnée et des bancs publics. En 2000, une nouvelle phase d’agrandissement a été lancée et officiellement inaugurée lors des Fêtes du Port de 2004.
Tous ces travaux ont coûté plusieurs centaines de millions d’euros, mais la préservation et le développement de l’ancien port de pêche et du bassin de chasse sont aujourd’hui un atout majeur pour le tourisme à Blankenberge, en particulier pour le quartier portuaire.